Окрім пригнічення росту та розмноження мікроорганізмів, вакуумна деоксигенація виконує ще одну важливу функцію – запобігання окисленню їжі. Оскільки жирна їжа містить багато ненасичених жирних кислот, вона окислюється під дією кисню, що робить їжу поганою на смак і псується. Крім того, окислення також спричиняє втрату вітаміну А та вітаміну С, а нестабільні речовини в харчових барвниках під впливом кисню потемніють. Таким чином, деоксигенація може ефективно запобігти псуванню їжі та зберегти її колір, аромат, смак і харчову цінність.